Начну с главного - большое спасибо Сергею за совет!
У ситуации небольшой поворот - машина едет и ничего менять пока не надо.
Проделали следующие действия - эндоскопом прочитал коды форсунок, дабы не выдирать и мучать их.
Зашёл в Клип и проверил, совпадают ли коды - там тоже всё ок.
На то время отзвонили из сервиса Delphi в Риге - добрый такой мастер и сказал, чтобы в Клипе накидал целую кучу параметров в запись, чтобы стало понятно, "что мозги думают", но перед этим надо "перетасовать" коды форсунок и потом уже записать правильные обратно (из-за того, что ЕБУ ругался на непрописанные форсунки). После этих операций покататся спокойно и записать параметры в реальной езде. Так я и сделал и что самое странное - уже после "перезаписи" кодов форсунок, двигатель завёлся спокойно и работал нормально, что и подтвердилось после отсылки логов специалисту.
Он посоветовал запланировать замену клапана 9307z516b и проверку тнвд, так как небольшые "проскоки" давления сохранились (порядка -20-30бар).
Ругань на непрописанные форсунки, скорее всего, была из-за долгого прокручивания двигателя после замены клапана и одного впрыска стартового аерозоля, чтобы двигатель побыстрее запустился.
Не сказал бы я что полюбил дизеля после этого...
Но и на бензин вменяемого возраста жену не пересадить из-за наших "добрых" налогов.
Надеюсь кому-то это поможет, так как таких моторов по-моему не мало и странности бывают.